Do danes ni nobenega posebnega zdravila proti Virus Epstein-Barr je bil razvit. Zato je terapija v glavnem obravnava fizičnih težav. Bolniki, ki trpijo za okužbo z EBV, naj si to lažje vzamejo in veliko počivajo.
To daje telesu priložnost, da se sam bori z virusom. Ker je Virus Epstein-Barr običajno vodi do povišana telesna temperatura, naj bolniki veliko pijejo, da nadomestijo izgubo tekočine. Če je povišana telesna temperatura je previsok ali vztraja predolgo, lahko bolniki jemljejo antipiretična zdravila v posvetovanju s svojim zdravnikom.
Ne samo zaradi tega je za prizadete pomembno, da se v primeru te bolezni posvetujejo z zdravnikom. Oslabljeni imunski sistem pogosto povzroča bakterijske superinfekcije, zlasti tonzil (tonzilitis). Te je treba zdraviti z antibiotiki.
Vendar pa aminopenicilini, kot so ampicilin in amoksicilin se ne sme uporabljati. Te pogosto povzročijo alergijske kožne reakcije v povezavi z virusom EB. Vendar to alergijska reakcija ni znak a penicilin alergijo, zato lahko nove bolezni po umirenju okužbe še vedno zdravimo s penicilini.
Alergijske kožne reakcije se običajno kažejo v obliki rdečega srbečega izpuščaja, ki se počasi širi po celotnem telesu in se po približno 3 dneh počasi umika. Ni nujno, da je ta kožna reakcija neposredno povezana z vnosom antibiotikov, vendar se lahko še vedno pojavi nekaj dni po koncu vnosa. V redkih primerih Virus Epstein-Barr lahko vodi tudi do vnetje možganov (virusno encefalitis), z anemijo povezano z okužbo (avtoimunska hemolitična anemija) ali pomanjkanje kri trombociti (trombocitopenijo).
Te bolezni zahtevajo hitro in dosledno zdravljenje z kortizon. Predvsem encefalititi zahtevajo tudi intenzivno zdravstveno oskrbo, da se izognemo sekundarnim boleznim. Bolezni kri zahtevajo redne preglede sistema laboratorijske vrednosti.
V nekaj primerih lahko virus Epstein-Barr povzroči tudi razširitev virusa Vranica. To najprej ni nevarno, vendar bi ga moral dobro upoštevati ultrazvok. Vendar obstaja nevarnost, da bo raztrgal Vranica kapsule, kar lahko privede do velike krvavitve. Iz tega razloga bi morali prizadeti bolniki biti še posebej previdni, dokler se velikost ne normalizira, da ne bi pretrgali kapsule.
