z Materino mleko, patogeni se lahko prenašajo in pri otrocih povzročijo ustrezno bolezen z različnimi manifestacijami poteka bolezni. Eden najpomembnejših patogenov v tem kontekstu je človek imunsko pomanjkanje virus (HIV).
HI virusi in okuženih z virusom HIV-1 limfociti je mogoče zaznati pri materinem mleko. Okužbo dojenčka dodatno spodbujajo vnetja in poškodbe bradavic, skozi katere pride do infekcijskega izločanja ran oz. kri lahko pobegne.
Če nezdravljena HIV pozitivna mati doji, se približno 10% otrok okuži prek Materino mleko v prvem letu življenja. V državah z dobrimi higienskimi standardi (industrializirane države) te matere ne smejo dojiti in dojenčke hraniti z nadomestnimi mleko Formula.
V državah s slabimi higienskimi standardi (države v razvoju) je drugače. Tu prevladujejo pozitivni vidiki dojenja, tako da WHO (World Zdravje Organizacija) priporoča, da matere dojijo svoje otroke kljub okužbi s HIV. Protiretrovirusno terapija začeti že v 14. tednu nosečnost in se nadaljevala do konca obdobja dojenja. Če je mogoče, je treba dojenčka prvih šest mesecev dojiti izključno. Tveganje prenosa virusa HIV po porodu je na ta način najmanjše. Nato se začne uvajanje dopolnilne hrane in dojenje se nadaljuje vsaj še 12 mesecev. Po študijah je stopnja okužbe največja pri delnem dojenju. Popolno prenehanje dojenja je povezano tudi z večjim tveganjem za okužbo pri otroku kot izključno dojenje. Razlog za to so lahko oligosaharidi, prisotni v Materino mleko. Poleg tega HIV protitelesa so bili zaznani v kolostrumu (kolostrum).
