Primeri bolezni, ki spadajo v okvir pediatrične kirurgije so
- Malformacije skeletnega sistema (npr. odvečni prsti na rokah ali nogah, ploska noga, lijakasti prsni koš) in v predelu glave (npr. razjeka ustnice in neba);
- Zlomi in izpahi kosti (npr. kolenske kapice);
- Opekline in kemične opekline;
- Poškodbe glave in hrbtenice;
- Motnje in malformacije centralnega živčnega sistema (npr. hidrocefalus, spina bifida = "odprt hrbet");
- Kontuzije in raztrganine na področju notranjih organov (npr. vranica, jetra, želodec, pljuča);
- benigni in maligni tumorji (npr. krvave spužve, Ewingov sarkom, Wilmsov tumor);
- Bolezni ščitnice in nadledvične žleze;
- Bolezni, motnje in malformacije prebavnega trakta (npr. zlatenica, črevesni polipi, zaužiti tujki);
- Bolezni, poškodbe in malformacije sečil in spolnih poti (npr. poškodba mehurja, fimoza, torzija testisa, malformacije maternice);
- Funkcionalne motnje urinarnega trakta (npr. močenje postelje);
- Kile (npr. dimeljska kila), malformacije popka, okvare trebušne stene, motnje diafragme;