Sledijo najpomembnejše motnje ali zapleti, ki se lahko sočasno pojavijo pri avtizmu:
Psiha - Živčni sistem (F00-F99; G00-G99).
- Anksiozne motnje
- Bipolarna motnja (manično-depresivna bolezen).
- Depresija
- Epilepsija
- Zmanjšana inteligenca - pojavi se hkrati v 50-75% primerov.
- Obsesivno kompulzivna motnja
Nadaljnje
- Prizadetost socialnega vedenja zaradi motenih veščin socialne komunikacije.
- Delinkventno vedenje pri posameznikih z Aspergerjev sindrom (2.74-26%) [S3 smernica].