E V nadaljevanju so najpomembnejše bolezni ali zapleti, ki jih lahko povzroči tudi borelioza:
Dihalni sistem (J00-J99)
- Faringitis (vnetje grla).
Oči in očesni dodatki (H00-H59).
- Iritis (vnetje šarenice).
- Konjunktivitis (vnetje veznice)
- Začasno slepota pri otrocih zaradi pritiska na optični živec (optični živec).
Srčnožilni sistem (I00-I99).
- kronična kardiomiopatijo - bolezen srce mišice.
- Razširjena kardiomiopatija (DCM)
- Lyme karditis (skupni izraz za vnetne bolezni srca) (približno 1% v Evropi):
- kronična kardiomiopatijo (srce bolezen mišic).
- Miokarditis (vnetje srčne mišice)
- Perikarditis (vnetje perikarda)
- Pankreatitis - vnetje celotnega srce.
- Srčne aritmije kot npr atrioventrikularni blok (AV blok).
- Sinkopa - kratka izguba zavesti.
Razširjenost (pojavnost bolezni) v Evropi 0.3–4%; v ZDA 1.5-10% vseh odraslih, nezdravljenih bolnikov z boreliozo
Skin in podkožno (L00-L99).
- Acrodermatitis chronica atrophicans Herxheimer (ACA; možen začetek po ugriz klopa: šest mesecev do nekaj let) - vnetno koža bolezen koncev telesa (po možnosti na ekstenzorski strani okončin) z atrofijo kože (tanjšanje kože) in obarvanjem livd (modrikasto) ter progasto fibrozo kože.
- Lymphadenosis cutis benigna Bäfverstedt - majhna, rdečkasto do modrikasto koža otekline (reaktivna hiperplazija limfoidnih celic), ki se lahko pojavijo zlasti na ušesnem mešičku po okužbi z borelijo.
Jetra, žolčnika in žolč kanali - trebušna slinavka (trebušna slinavka) (K70-77; K80-K87).
- Hepatitis (vnetje jeter)
Mišično-skeletni sistem in vezivnega tkiva (M00-M99).
- Artropatija (patološke spremembe sklepov).
- Lymski artritis (kot mono- ali oligoartritis / pojav artritisa (vnetja sklepov) v manj kot 5 sklepih) - običajno prizadene velike sklepe, kot je kolenski sklep (85% primerov); manifestacija v pozni fazi bolezni (nekaj tednov do mesecev / morda do dve leti po prenosu patogena)
Psiha - Živčni sistem (F00-F99; G00-G99).
- Ataksija (motnje hoje)
- Kronični encefalomielitis - vnetje možganov (encefalitis) in hrbtenjača (mielitis) s parezo (paraliza).
- Encefalitis (vnetje možganov)
- Encefalopatija - možganov spremembe, ki lahko vodi do spomin težave, motnje spanja in motnje razpoloženja, med drugim.
- Pareza obraza - paraliza obrazni živec z vogalom usta visi na eni strani.
- Meningitis (meningitis) - izoliran meningitis (brez radikularnih simptomov) v Evropi opažamo predvsem pri otrocih.
- Mielitis - vnetje hrbtenjače
- Nevritis (vnetje živcev)
- Nevropatija (poškodba živca)
- Po zdravljenju Lymska bolezen Sindrom (PTLDS) - po zdravljenju se simptomi pogosto pojavijo prek nespecifičnih simptomov, kot je npr utrujenost, oslabljen koncentracija in spomin, cefalgija (glavobol), nespečnost (motnje spanja) in mialgija.
- bolečina zaradi polinevropatija (bolezen živci perifernih živčni sistem; odvisno od vzroka so lahko prizadeti motorični, senzorični ali avtonomni živci; motnje občutljivosti).