Obstaja veliko nalezljive bolezni ki jih lahko povzroči pnevmokok. Glavni med njimi so:
Dihalni sistem (J00-J99)
- Pljučnica (pljučnica)
- Rinosinusitis - vnetje nosu in sinusov.
- sinusitis (vnetje obnosnih votlin).
- Traheobronhitis - vnetje sapnika in bronhijev.
Oči in očesni dodatki (H00-H59).
- Razjeda roženice serpens (čir na roženici).
Kardiovaskularni sistem (I00-I99)
- Endokarditis (vnetje notranje stene srce).
- Perikarditis (vnetje perikarda)
usta, požiralnik (požiralnik), želodecin črevesje (K00-K67; K90-K93).
- Slepiča ("Slepiča").
- Peritonitis ("vnetje peritoneuma")
Ušesa - mastoidni odtenek (H60-H95)
- mastoiditis (vnetje mastoidnega procesa).
- Otitis media (vnetje srednjega ušesa)
Psiha - živčni sistem (F00-F99; G00-G99)
Genitourinarni sistem (ledvice, sečila – reproduktivni organi) (N00-N99).
Drugače se lahko upoštevajo tudi druge bakterijske in virusne okužbe:
- Bakterijski patogeni
- Klamidija
- Haemophilus influenzae
- Moraxella catarrhalis
- Mikoplazma
- Virusni patogeni
- Adenovirusi
- Človeški koronavirusi (OC43, 229E)
- Virusi gripe
- Paramyxoviruses (tj. Virus RS)
- Pikornavirusi (zlasti rinovirusi).